182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5568 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  51.34 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  43.61 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  41.95 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  37.88 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  36.09 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  34.38 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  33.97 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  36.63 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  33.21 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  31.44 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  47.87 
 
 		 226 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  53.57 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  51.69 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  47.87 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  59.49 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  44.44 
 
 		 224 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  50 
 
 		 200 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  50 
 
 		 196 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  28.57 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  28.69 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  46.34 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  47.87 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  44.09 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  38.04 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  44.68 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  42.55 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  48.39 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  37.07 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  40.7 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  40.7 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  40.7 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  40.7 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  40.7 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  40.7 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  40.7 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  45.16 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  28.35 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  27.24 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  37.36 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  28.34 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  27.32 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  40.62 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  40.45 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  42.53 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  42.53 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  42.57 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  37.25 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  46.55 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  50 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  33.79 
 
 		 172 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  43.94 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  32 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  31.67 
 
 		 172 aa  52  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  27.67 
 
 		 569 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  50.94 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  31.13 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  49.02 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  37.23 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.63 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  39.73 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  36 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  31 
 
 		 444 aa  49.7  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  36.89 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  41.18 
 
 		 342 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  37.11 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  39.36 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  50 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  51.06 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  48.08 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  23.53 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  46.81 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  38 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  36.89 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  42.31 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  37.65 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  53.06 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  46.67 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  49.02 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  42.59 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  31.18 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  37.8 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  39.22 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  43.55 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  36.89 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  35 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1937  rhomboid family protein  33.03 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  39.62 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  36.89 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  35.09 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.78 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  38.61 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>