More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0019 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  64.62 
 
 		 286 aa  262  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  59.07 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  49.38 
 
 		 292 aa  215  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  53.6 
 
 		 315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  52.02 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  53.88 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  46.96 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  47.52 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  45.11 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  45.11 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  45.11 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  48.89 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  44.59 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  44.5 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  47.74 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  46.61 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  39.74 
 
 		 287 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  44.02 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  42.4 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  44.3 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  39 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  42.86 
 
 		 306 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  40.42 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.76 
 
 		 303 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  38.01 
 
 		 359 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  44.75 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  33.8 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  40 
 
 		 298 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  45.77 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  36.84 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  44.29 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  35.59 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  37.93 
 
 		 336 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  40.34 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  34.68 
 
 		 365 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 381 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 342 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  36.32 
 
 		 274 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  38.69 
 
 		 342 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  39.38 
 
 		 317 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  36.18 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  39.87 
 
 		 283 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 327 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  35.03 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  34.44 
 
 		 519 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  30.46 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  41.67 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  35.75 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  32.16 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  39.6 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.6 
 
 		 579 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  42.76 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  35.37 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  31.53 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  38.92 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  34.13 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  39.33 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  39.88 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  33.74 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  31.67 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  32.35 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  32.93 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  35 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  34.16 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  34.09 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  40.76 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  29.32 
 
 		 511 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  36.91 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.82 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  32.51 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  33.33 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  34.13 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  35.92 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  29.8 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  28.95 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  29.84 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  34.76 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  34.16 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  28.42 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  29.11 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  35.42 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  46.81 
 
 		 369 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  35.9 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  35.81 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  34.91 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  34.71 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  31.94 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  34.93 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  35.71 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  28.64 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.12 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  38.3 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  38.26 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>