254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0559 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1218  rhomboid family protein  45.98 
 
 		 253 aa  185  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1256  rhomboid family protein  45.54 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1937  rhomboid family protein  44.34 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1723  rhomboid-like protein  39.01 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  38.12 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  37.44 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1045  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  32.64 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2202  hypothetical protein  33.62 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5215  hypothetical protein  34.06 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  normal  0.0537832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3898  Rhomboid family protein  40.85 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1648  rhomboid-like protein  39.63 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5125  Rhomboid family protein  26.34 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2535  Rhomboid family protein  27.34 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.87171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  32.48 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  36.63 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2260  rhomboid family protein  26.97 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2217  Rhomboid family protein  26.92 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  30.97 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1320  rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4634  rhomboid family protein  33.13 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.248838  normal  0.0634854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0940  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3232  rhomboid family protein  25.84 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0778349  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  30.97 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  28.94 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  31.2 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.11 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  35.57 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  33.48 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  32.35 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  30.7 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  32.4 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  35.37 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  26.75 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0720  Rhomboid family protein  30.18 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  29.58 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  29.91 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  35.19 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  27.59 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  31.82 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  29.44 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  29.09 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  30.7 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  30.8 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  31.6 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  26.42 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.15 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  31.95 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  29.82 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  26.36 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  25.79 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  29.49 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  32.41 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  30.05 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  26.12 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  30.7 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  27.85 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  28.44 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  33.76 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  27.27 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  30.43 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  30.13 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  25.52 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  27.03 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  25.52 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  30.4 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  27.62 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  30.34 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  28.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  25.64 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  27.65 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  26.81 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  26.15 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  27.65 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  29.48 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  30 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  26.85 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  35.88 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  38.1 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  28.16 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  24.6 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  28.16 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  40.26 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  30.12 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  38.96 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  28.16 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3678  rhomboid family protein  40.26 
 
 		 483 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0309467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  33.88 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  29.03 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  27.36 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  27.56 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  27.36 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>