249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1853 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  91.63 
 
 		 263 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2202  hypothetical protein  53.01 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1045  rhomboid family protein  44.25 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  42.92 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  37.5 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1218  rhomboid family protein  36.03 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4634  rhomboid family protein  39.41 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.248838  normal  0.0634854 
 
 
-
 
NC_004310  BR1256  rhomboid family protein  36.03 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1648  rhomboid-like protein  39.84 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1723  rhomboid-like protein  40.44 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  37.44 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5125  Rhomboid family protein  38.49 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2535  Rhomboid family protein  36.4 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.87171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3898  Rhomboid family protein  38.27 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3232  rhomboid family protein  38.4 
 
 		 273 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0778349  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1937  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2260  rhomboid family protein  36.4 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2217  Rhomboid family protein  34.5 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5215  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  normal  0.0537832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  36.82 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  35.56 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  36.09 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1320  rhomboid-like protein  39.08 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0940  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0720  Rhomboid family protein  34.13 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  31.98 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  30.37 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  30.33 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  31.39 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  30 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  30.14 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  30 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  31.28 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  31.16 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  28.45 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  32.74 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  27.51 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  33.52 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  27.43 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  27.88 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  30.45 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  32.04 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.6 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  31.68 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  29.2 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  30.88 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  31.28 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  29.21 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  25.69 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.54 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.45 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  39.18 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  27.59 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  29.11 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  33.87 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  29.2 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.9 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  28.28 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  30.57 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  35 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  30.11 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  29.73 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  26.8 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  31.35 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  38.38 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  26.5 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  29.31 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  27.16 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  29.65 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  28.85 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  27.48 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  26.02 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  27.36 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2815  rhomboid family protein  34.13 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  26.54 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  29.57 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  29.26 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  30.77 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  28.99 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  25.86 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  29.78 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  24.19 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  25.86 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  27.98 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  29.15 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  31.01 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0440  rhomboid family protein  34.27 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0337816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  26.91 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  30.67 
 
 		 625 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  25.81 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  29.34 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  29.95 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  29.28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  34.78 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>