268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1723 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1723  rhomboid-like protein  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1256  rhomboid family protein  48.47 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1218  rhomboid family protein  48.47 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1937  rhomboid family protein  47.69 
 
 		 226 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  39.84 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  37.39 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2202  hypothetical protein  39.52 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  39.76 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1045  rhomboid family protein  39.04 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  40 
 
 		 266 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4634  rhomboid family protein  34.31 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.248838  normal  0.0634854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  38.72 
 
 		 266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2217  Rhomboid family protein  36.19 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2260  rhomboid family protein  35.58 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  37.61 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0940  rhomboid family protein  34.6 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2535  Rhomboid family protein  34.46 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.87171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5125  Rhomboid family protein  32.01 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5215  hypothetical protein  39.42 
 
 		 264 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  normal  0.0537832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3898  Rhomboid family protein  35.5 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3232  rhomboid family protein  32.85 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0778349  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  35.11 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  35.59 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1648  rhomboid-like protein  32.77 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  35.92 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  36.84 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  36.54 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  34.85 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  29.46 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  35.47 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.2 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  32.54 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  35.98 
 
 		 375 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  32.08 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  35.42 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  28.32 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  38.12 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  30.87 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  38.69 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  33.87 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1320  rhomboid-like protein  33.9 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.27 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  31.34 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  29.25 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  36.94 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  32.52 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  35.26 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  30.84 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  33.96 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0720  Rhomboid family protein  31.55 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  29.22 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  29.07 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  31.86 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  39.1 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  34.67 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  33.73 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  29.65 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  32.42 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  35.58 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  34.12 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.95 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  37.82 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  34.57 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.25 
 
 		 232 aa  72  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  28.14 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  37.5 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  29.78 
 
 		 444 aa  72  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  30.18 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.42 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.66 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  35.52 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2815  rhomboid family protein  38.99 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  30.53 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0440  rhomboid family protein  31.68 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0337816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  33.72 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  31.22 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  29.72 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.87 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  31.84 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  30.86 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  43.59 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.69 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  31.31 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  34.69 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  31.4 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  34.94 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  43.75 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  33.55 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.2 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.29 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>