262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2815 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2815  rhomboid family protein  100 
 
 		 241 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.13 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  42.95 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  39.74 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  39.05 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  35.75 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  38.85 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  32.78 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.03 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  40.13 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  36.97 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  36.31 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  36.77 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  45.28 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  35 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  37.75 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  33.99 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  35 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  35.56 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  35.67 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.19 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.19 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  36.18 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  35.67 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  35.67 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  42.77 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  32.61 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.92 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  41.51 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  36.59 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  30.6 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  36.59 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  34.39 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1723  rhomboid-like protein  39.62 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  37.97 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.9 
 
 		 519 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.77 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  36.31 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  36.02 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0720  Rhomboid family protein  42.5 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  27.23 
 
 		 554 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  33.55 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  38.18 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  34.34 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  29.68 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  31.76 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  34.73 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  38.04 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  32.12 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  29.44 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  37.25 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  32.32 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  33.99 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  35.76 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  33.73 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  36.21 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  37.21 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  37.42 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.12 
 
 		 486 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 292 aa  62  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.81 
 
 		 279 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  37.13 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  34.18 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  29.73 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  32.02 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  28.43 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  28.43 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  37.01 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2202  hypothetical protein  36.02 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  34.25 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.55 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  44 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  37.35 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  36.91 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  32.35 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  32.67 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  30.36 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  36.73 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1937  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  29.21 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  28.4 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.76 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0440  rhomboid family protein  34.34 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0337816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1084  rhomboid family protein  33.47 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0579357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  29.65 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  37.7 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  31.48 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>