More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2879 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  74.76 
 
 		 232 aa  299  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  70.83 
 
 		 220 aa  293  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  70.37 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  57.77 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  55.29 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  51.4 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  51.15 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  48.62 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  49.28 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  47.37 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  38.1 
 
 		 278 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  43.5 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  40.26 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  41.7 
 
 		 276 aa  141  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  41.71 
 
 		 197 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  39.04 
 
 		 283 aa  138  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  46.15 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  40.09 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  40.39 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  39.9 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  39.61 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  47.02 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  47.02 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  39.91 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  47.02 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  38.86 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  47.02 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  47.02 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  47.02 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  47.02 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  30.59 
 
 		 247 aa  121  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  31.52 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  48.68 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  48.68 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  40.13 
 
 		 209 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.83 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  47.87 
 
 		 259 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  36.91 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  47.01 
 
 		 277 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  39.44 
 
 		 279 aa  92  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  53.09 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  34.25 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  51.19 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  30.43 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  30.45 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  35.03 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  37.13 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  46.25 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  35.85 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.76 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  35.53 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.33 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  35.88 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  30.17 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  51.22 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  28.33 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  34.66 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  31.22 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  35.86 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  31.92 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  32.91 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  32 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  31.07 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.15 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  30.29 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  31.19 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  27.66 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.55 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  31.17 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  34.67 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  37.42 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 444 aa  72  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  37.42 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  33.49 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  30.85 
 
 		 315 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  31.62 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.94 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  37.66 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  32.09 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  31.05 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  28.14 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.81 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  35.1 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  37.01 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  34.39 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  31.3 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  41.18 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  32.72 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  34.3 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  36.57 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  29.52 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  31.63 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  33.48 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>