More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0391 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1039  serine protease  100 
 
 		 202 aa  383  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  100 
 
 		 202 aa  383  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  100 
 
 		 202 aa  383  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  100 
 
 		 202 aa  383  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  99.01 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  98.51 
 
 		 260 aa  380  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  99.01 
 
 		 229 aa  380  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  87.13 
 
 		 234 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  58.79 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  57.07 
 
 		 198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  55.05 
 
 		 197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  49.5 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  49.5 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  44.27 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  40.2 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  40.51 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  40 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  44.67 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  38.54 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  42.19 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  43.58 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  47.02 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  39.42 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  39.79 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  36.45 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  34.31 
 
 		 283 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  48.91 
 
 		 155 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  36.76 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 276 aa  97.1  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  36.67 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  33 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  40.64 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  36.04 
 
 		 444 aa  92.8  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  43.14 
 
 		 285 aa  91.3  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  26.02 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  38.89 
 
 		 263 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  34 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  26.67 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  32.82 
 
 		 222 aa  85.5  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  33.18 
 
 		 252 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  30.85 
 
 		 241 aa  84.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.98 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  32.69 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  39.88 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  37.23 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  38.27 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  33.8 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  36.05 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  32.38 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  31.22 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  40.41 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  26.11 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  36.73 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  29.91 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  32.54 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  31 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  33 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  36.25 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  29.68 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  31.86 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  37.38 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  31.19 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  34.56 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  33.99 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  36.18 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  35.51 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  39.07 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  33.73 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  29.89 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  37.14 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  34.25 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  29.85 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  32.99 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.4 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  31.19 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  32.66 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  35.9 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  32.64 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  33.14 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  35.9 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  33.49 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.18 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  28.92 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  37.11 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>