More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4665 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  38.69 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  40.51 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  37.95 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  36.41 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  37.68 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  38.24 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  39.34 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  36.32 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  35.78 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  35.07 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  33.65 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  36.24 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  37.58 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  36.24 
 
 		 220 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  38.65 
 
 		 200 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  41.88 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  31.3 
 
 		 241 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  40.36 
 
 		 197 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  36.91 
 
 		 224 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  37.21 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  33.8 
 
 		 196 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  37.21 
 
 		 260 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  38.22 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  37.21 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  43.71 
 
 		 202 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  43.71 
 
 		 202 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  43.71 
 
 		 202 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  43.71 
 
 		 202 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  35.65 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  36.31 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  34.57 
 
 		 198 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  31.28 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  31.52 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  30.89 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  29.15 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  35.26 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  31.92 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  31.15 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  32.24 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  36.1 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  33.95 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  37.06 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  33.01 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  33.8 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  32.14 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  30.26 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  34.58 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  31.6 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  29.6 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  30.11 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  32.94 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.98 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  29.11 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  30.67 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  30.32 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  30.6 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  28.49 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  29.78 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  30.15 
 
 		 486 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  29.49 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  29.29 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  36.05 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  31.94 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  33.13 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  34.75 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  34.75 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  34.45 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  30.48 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.91 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  31.28 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  29.86 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  28.96 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  30.45 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.68 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  47.62 
 
 		 155 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  28.9 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  34.13 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  30.7 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  36.05 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  31.85 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  29.49 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  32.7 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  32.32 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  29.3 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  27.32 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  29.56 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>