151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0633 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  523  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  41.95 
 
 
259 aa  201  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  42.16 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  40.15 
 
 
264 aa  191  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  40.3 
 
 
277 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  35.45 
 
 
247 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  35.79 
 
 
249 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  34.57 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  34.16 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  30.71 
 
 
226 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  30.48 
 
 
258 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  58.14 
 
 
228 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  46.23 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  57.32 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  45.28 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  44.34 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  51.19 
 
 
224 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  42.59 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  49.41 
 
 
196 aa  82  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  41.51 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  48.86 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  47.19 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  50.63 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  43.02 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  43.02 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  42.05 
 
 
197 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  43.02 
 
 
229 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  41.76 
 
 
198 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  43.02 
 
 
202 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  46.84 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  46.84 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  43.02 
 
 
202 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  43.02 
 
 
202 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  43.02 
 
 
202 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  41.86 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  48.1 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  44.83 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  43.53 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  27.1 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  52.17 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  52.17 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  40.62 
 
 
176 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  24.71 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  37.5 
 
 
177 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  22.76 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  49.09 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  36.51 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  31.96 
 
 
190 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  38.03 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.55 
 
 
486 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  30.84 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.14 
 
 
205 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  22.27 
 
 
207 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  24.6 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  32.95 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  37.5 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  31.91 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  39.76 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  35.11 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.59 
 
 
487 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.59 
 
 
487 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  39.71 
 
 
172 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  36.26 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  33.78 
 
 
232 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  30.68 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  39.71 
 
 
172 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  25.31 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  34.91 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  25.81 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  39.22 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  36.21 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  26.9 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  38.46 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  39.62 
 
 
342 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  37.14 
 
 
238 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  26.92 
 
 
267 aa  49.3  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  35.48 
 
 
218 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  37.93 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  38.46 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  35.92 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  30 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  26.7 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  36.67 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  32 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  28.83 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35318  predicted protein  34.94 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  27.33 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  28.3 
 
 
365 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  45.83 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  37.5 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  44.44 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.28 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  33.9 
 
 
369 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  35.56 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  26.7 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
625 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  33.33 
 
 
625 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  40 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>