154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3495 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.5 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  37.11 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  32.77 
 
 		 273 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  31.49 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  28.9 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  31.1 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  30.85 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.99 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  29.79 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  35.65 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  29.54 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  26.07 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  33.01 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  24.18 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  28.83 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  28.63 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  32.51 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  33.93 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  35.71 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  36.46 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  31.92 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  29.26 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  37.66 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  37.72 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  27.6 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  36.77 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  32.37 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  27.73 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  30.74 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  36 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  27.18 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.77 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  32.42 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  26.25 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  30.85 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  32.77 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  37.84 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  37.84 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  39.86 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  27.8 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35318  predicted protein  28.22 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.07 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  39.6 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  39.6 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  39.6 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  39.6 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.54 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  28.48 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  30.65 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  31.3 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  29.07 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  35.93 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  46.07 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  35.33 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  40.96 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  29.24 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  26.84 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  26.59 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  26.8 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  33.11 
 
 		 197 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1812  hypothetical protein  25.28 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.515033  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  29.22 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  27.35 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  31.4 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  29.22 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  28.92 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  39.51 
 
 		 528 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  35.16 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  37.12 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  34.44 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 523 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  31.82 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  27.46 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  25.31 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  32.99 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  35.16 
 
 		 520 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  27.6 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  28.64 
 
 		 571 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  35.16 
 
 		 520 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  24.88 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.24 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.24 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  25.2 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  35 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  32.81 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  36.43 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  29.25 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  31.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  33.99 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  38.2 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.86 
 
 		 541 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  26.42 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  26.62 
 
 		 554 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  37.04 
 
 		 525 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>