291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6787 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  51.27 
 
 		 279 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  47.42 
 
 		 212 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  45.99 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  42.93 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  41.03 
 
 		 203 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  36.02 
 
 		 205 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  37.71 
 
 		 204 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  35.16 
 
 		 207 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  36.65 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  34.39 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  37.25 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  34.39 
 
 		 202 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  33 
 
 		 205 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  33.33 
 
 		 202 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  30.39 
 
 		 230 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  30.39 
 
 		 202 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  30.25 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.47 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  31.47 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.96 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  31.64 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  28.22 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  33.82 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  36 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.36 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.29 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  34.06 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  36.91 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  33.96 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  38.54 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  38.54 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  25.2 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  27.27 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  28.51 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  27.27 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  34.06 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  33.33 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  42.39 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  35.22 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  34.69 
 
 		 571 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  31.54 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  37.7 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  29.9 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.06 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  29.71 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  27.97 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  29.55 
 
 		 492 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  35.33 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  30.64 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  30.64 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  27.59 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  31.31 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  30.81 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.54 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6690  hypothetical protein  42.65 
 
 		 71 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  25.49 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  31.4 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  31.82 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  27.75 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  34.39 
 
 		 569 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  29.45 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.93 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  28.99 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  27.93 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  29.68 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.05 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  38.24 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.97 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  27.84 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  25.91 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  37.39 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  30.51 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  34.04 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  28 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  32.59 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.49 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  32.59 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  40 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  32.59 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  32.59 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  31.82 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  31.82 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>