171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0099 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  43.24 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  39.11 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  38.86 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  41.11 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  40.2 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  41.76 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  42.78 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  39.46 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  39.25 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  38.71 
 
 		 230 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  36.02 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  41.28 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  36.92 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  34.54 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  34.54 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  33.69 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  36.93 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  33.15 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  34 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  35.39 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  29.33 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  28.77 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  28.97 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  28.77 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  28.28 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  28.28 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  28.28 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  28.28 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  26.26 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  29.08 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.63 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  31.79 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  27.56 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  25.27 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  24.87 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  27.11 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  27.07 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  38.27 
 
 		 528 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  31.97 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  31.2 
 
 		 330 aa  52  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  31.18 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  28.36 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.54 
 
 		 541 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28.47 
 
 		 486 aa  52  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  33.59 
 
 		 547 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  29.36 
 
 		 284 aa  51.6  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  32.98 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  34.86 
 
 		 571 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  28.66 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  31.13 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  28.8 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  29.58 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  27.13 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  36.63 
 
 		 541 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  27.54 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  31.13 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  27.08 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  27.08 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  27.27 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  34.02 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  26.47 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  36.71 
 
 		 523 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  26.78 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.45 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  32.67 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  28.31 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  24.54 
 
 		 283 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  34.09 
 
 		 245 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  29.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 520 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  27.31 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  31.96 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  34.83 
 
 		 356 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  33.68 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 520 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  30.84 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  27.27 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  27.03 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  25.79 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  34.57 
 
 		 525 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  26.11 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  27.96 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  29.17 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.53 
 
 		 303 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  32.32 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  24.48 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  23.63 
 
 		 362 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  25 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>