279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1449 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  33.49 
 
 		 225 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  38.27 
 
 		 224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  33.33 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  30.7 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  43.17 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  41.84 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  30.52 
 
 		 519 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 389 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  31.66 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  30.04 
 
 		 386 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  32.51 
 
 		 511 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.5 
 
 		 358 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  31.14 
 
 		 365 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  30.51 
 
 		 342 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  34.8 
 
 		 287 aa  89  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  36.13 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  36.51 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  29.71 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  29.66 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.47 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  33.48 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  32.2 
 
 		 327 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.16 
 
 		 569 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.8 
 
 		 289 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.8 
 
 		 289 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.8 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  37.85 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.11 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.11 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  33.69 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  29.65 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  35.08 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  31.89 
 
 		 371 aa  82  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  35.9 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  32.47 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  36.17 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.4 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  31.82 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  34.38 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  33.13 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28.8 
 
 		 486 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  29.48 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  32.74 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.86 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.38 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  33.91 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  34.59 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  35.68 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  33.89 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  30.43 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  34.52 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  35.08 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  29.8 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  36.02 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  34.19 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  34.19 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  29.52 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.15 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  33.03 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  29.57 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  37.34 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  31.91 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  37.1 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  33.15 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  32.8 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  31.44 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  30.94 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  33.58 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  30.69 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  30.9 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.79 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  32.16 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  34.69 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  28.87 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  35.88 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  31.18 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  28.35 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  28.64 
 
 		 541 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  36.3 
 
 		 444 aa  65.5  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  30.37 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  29.52 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  30.52 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  31.69 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  31.47 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  29.47 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  28.18 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  29.47 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  30.37 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.07 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  32.46 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  35.16 
 
 		 525 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.07 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>