267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4502 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  100 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  61.5 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  47.42 
 
 		 280 aa  168  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  40.59 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  43.07 
 
 		 279 aa  154  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  42.78 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  41.86 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  37.36 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  40.48 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  37.57 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  37.57 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  34.05 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  34.55 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  34.05 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  39.61 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  35.39 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  32.98 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  32.58 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  41.48 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  36.49 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.91 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  31.85 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  38.69 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.72 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  30.81 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  33.79 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  33.8 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  34.27 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  35.14 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  31.68 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  33.1 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  33.79 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  33.11 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  33.78 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  34.06 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  36.05 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  39 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  34.53 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  38.26 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.08 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.23 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  30.63 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  33.9 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  32.67 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  34.03 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  31.93 
 
 		 669 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.31 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 444 aa  62  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  40.48 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  37.09 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  35.33 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  39.33 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  30.82 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  34.07 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  33.1 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  31.62 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  30.51 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  32.24 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  31.76 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  31.21 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  41.46 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  31.51 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  35.21 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  35.21 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  34.75 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  30.38 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  33.82 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  31.54 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  33.82 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  32.62 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  30.41 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  34.19 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  30.87 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  33.33 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  32.64 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  30.56 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.79 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  29.8 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  32.05 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>