110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05400 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  652    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  30.33 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  34.96 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  31.71 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  32.77 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  29.88 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  35.45 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  31.73 
 
 		 197 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  38.38 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  31.61 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  30.63 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  32.2 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.91 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  27.17 
 
 		 571 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 511 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  30.36 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  31.73 
 
 		 198 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  30.77 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  31.2 
 
 		 205 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  29.57 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  34.55 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  26.79 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.94 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  29.17 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  28.97 
 
 		 264 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.24 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  27.56 
 
 		 444 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  33.65 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  33.65 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  26.79 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  33.65 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  25.74 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  27.49 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.45 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  26.17 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  34.62 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  27.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  25.87 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  31.09 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 205 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  27.87 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.72 
 
 		 486 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  33.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  27.1 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  27.27 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  33.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  33.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  33.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  32.73 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  24.27 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 172 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 234 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  33.91 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 208 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  29.84 
 
 		 520 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 487 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 487 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  33.04 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  30 
 
 		 246 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  28.43 
 
 		 228 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  28.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  34.44 
 
 		 245 aa  46.2  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  36.84 
 
 		 569 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  28.57 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  36.71 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  32.48 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  32.93 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.91 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  29.05 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  33.93 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  39.47 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  26.4 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  31.87 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  28.97 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  30.17 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  28.3 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  29.03 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  43.64 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  36 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  27.27 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  29.73 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  28.4 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.07 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  35 
 
 		 218 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  27.5 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  37.7 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>