201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0404 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  100 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  57.07 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  40.09 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  38.95 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  32.98 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  36.93 
 
 		 386 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  28.37 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.51 
 
 		 486 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 389 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  36.26 
 
 		 327 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  34.57 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  41.18 
 
 		 303 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  35.4 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  31.22 
 
 		 376 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.35 
 
 		 342 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  32.37 
 
 		 348 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 303 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  35.86 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  35.86 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  32.29 
 
 		 365 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  35.17 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  35.17 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.35 
 
 		 342 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  35.17 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.73 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  27.84 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.52 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  27.23 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  29.67 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  27.23 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  34.39 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  32.41 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  30.81 
 
 		 358 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  37.12 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  34.03 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  29.88 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  35.85 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  36.26 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  36.26 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  36.26 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  28.65 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  31.72 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  30.5 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  26.37 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.71 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  33.97 
 
 		 519 aa  72  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  27.87 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  37.88 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  33.13 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  32.12 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  28.41 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.77 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  36.61 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  30.17 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  28.9 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  29.38 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  30.2 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  29.7 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.94 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2170  rhomboid family protein  32.81 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000411867 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  31.71 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  38.38 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  36.43 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  34.29 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  30.26 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  30.17 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  27.87 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  30.3 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.8 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  32.79 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.31 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  25.97 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  26.48 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  26.67 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  31.34 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  35.17 
 
 		 556 aa  57  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  31.55 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 		 625 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  30.16 
 
 		 625 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  28.39 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.16 
 
 		 625 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 547 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 541 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  36.52 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1441  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  29.79 
 
 		 513 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  31.43 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  27.95 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  37.25 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 444 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  31.45 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>