254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1655 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  100 
 
 		 376 aa  757    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  85.64 
 
 		 348 aa  629  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  64.79 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  36.84 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  36.55 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.97 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.01 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.03 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  34.83 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.76 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  32.98 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  34.36 
 
 		 219 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.14 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  35.1 
 
 		 283 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 541 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  37.75 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  30.96 
 
 		 275 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  34.3 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 523 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.12 
 
 		 286 aa  86.7  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  34.62 
 
 		 625 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  29.07 
 
 		 227 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 279 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 235 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  34.52 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 235 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.79 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  32.08 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  31.19 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  32.79 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  32.02 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  38.13 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  32.35 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.82 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  34.97 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  26.89 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  40 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  32.97 
 
 		 625 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  33.13 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  33.93 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.14 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  31.09 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.79 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  23.9 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  33.79 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  29.1 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  38.3 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  30.92 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.35 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.74 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  33.11 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.89 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  34 
 
 		 287 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  32.7 
 
 		 511 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  30.86 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  34.9 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.47 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  29.85 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  28.72 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  33.57 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  32.87 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  28.21 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  28.21 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  31.25 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  29.94 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.08 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  31.11 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.54 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  28.82 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  36.91 
 
 		 306 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  30.73 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  28.16 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  28.99 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  32.65 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  32.41 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  32.93 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  31.32 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  31.25 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  28.27 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  34.09 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  27.81 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>