270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1811 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  57.07 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  42.11 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  31.05 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  42.86 
 
 		 386 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  42.29 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  34.24 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  47.59 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  44.83 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  35.94 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  35.2 
 
 		 486 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 342 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  35.2 
 
 		 487 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  35.2 
 
 		 487 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  32.4 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  34.29 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.92 
 
 		 389 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  39.26 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  38.17 
 
 		 327 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  36.16 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.94 
 
 		 365 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  35.11 
 
 		 284 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  36.59 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  35.15 
 
 		 376 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  37.29 
 
 		 290 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  32 
 
 		 569 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  33.98 
 
 		 348 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.72 
 
 		 554 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  32.94 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  34.35 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.75 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.93 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  35 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  35 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  34.29 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  38.73 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  32.54 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  34.34 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  34.29 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  29.44 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  32.45 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  31.87 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  32.39 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.63 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.84 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  36.67 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.84 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.07 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.77 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  33.82 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  39.42 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  34.55 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  33.7 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  28.83 
 
 		 371 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  32.69 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.51 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  30 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  34.67 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 302 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 293 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  28.86 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  30.65 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  30.71 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  30.11 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  42.99 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  29.71 
 
 		 141 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  32.62 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.56 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  36.04 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.77 
 
 		 556 aa  69.7  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  33.78 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  37.42 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  30.32 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  25.77 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  31.29 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  32.17 
 
 		 747 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  36.73 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  29.26 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  32.34 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  28.49 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.56 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  28.88 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  35.78 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  33.78 
 
 		 570 aa  65.5  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  32.86 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  28.21 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2170  rhomboid family protein  35.06 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000411867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>