More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0674 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  100 
 
 		 227 aa  448  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  36.24 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  33.62 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.67 
 
 		 386 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  31.05 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  33.64 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  34.54 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  34.84 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  35.23 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 342 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 342 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.56 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.18 
 
 		 554 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  37.62 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.92 
 
 		 389 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  31.84 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  33 
 
 		 519 aa  99  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.7 
 
 		 356 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  36.91 
 
 		 303 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.22 
 
 		 356 aa  95.5  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  38.93 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  35.44 
 
 		 569 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  37.33 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  34.07 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.59 
 
 		 371 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  36.11 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  35.51 
 
 		 263 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  35.98 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  35.85 
 
 		 396 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  29.07 
 
 		 376 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  34.01 
 
 		 287 aa  86.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  34.59 
 
 		 365 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35.15 
 
 		 511 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  34.29 
 
 		 381 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  36.23 
 
 		 279 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  36.5 
 
 		 205 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  30.09 
 
 		 289 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  29.86 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  29.77 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.68 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  39.39 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.21 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  35.33 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  31.25 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  32.57 
 
 		 541 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  28.16 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.44 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  35 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  36.81 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  37.04 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  36.81 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  32.35 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.18 
 
 		 579 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  34.88 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  35.61 
 
 		 369 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  44.09 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  31.12 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  30.24 
 
 		 358 aa  78.2  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  34.21 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  30.85 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  33.7 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  31.89 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  31.11 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 486 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  32.26 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  31.79 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  29.31 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  31.14 
 
 		 747 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  31.87 
 
 		 291 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  27.35 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  34.51 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  34.51 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  34.75 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  34.11 
 
 		 547 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  34.11 
 
 		 541 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  38.46 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  27.05 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 422 aa  68.9  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  26.73 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  35.77 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 295 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1188  rhomboid family protein  42.68 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0257893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 340 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  32.66 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  33.17 
 
 		 360 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  29.11 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  31.25 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  38.81 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.48 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>