296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0207 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  52.88 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  33.89 
 
 
190 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  33.89 
 
 
190 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  36.42 
 
 
190 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  36.42 
 
 
190 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  33.33 
 
 
190 aa  104  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  35.76 
 
 
190 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  36.11 
 
 
182 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  34.44 
 
 
186 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  36.11 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  35.86 
 
 
190 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  34.87 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.33 
 
 
486 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  32.67 
 
 
386 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.63 
 
 
396 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.84 
 
 
519 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  32.68 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.28 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  29.41 
 
 
554 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.75 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.62 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.75 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  34.88 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  32.39 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.16 
 
 
569 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  31.69 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.19 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  31.69 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  32.93 
 
 
271 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  28.66 
 
 
511 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  34.08 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  33.58 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  36.23 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  31.62 
 
 
389 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.98 
 
 
371 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  30.63 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  31.72 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  27.68 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.43 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  32.89 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  31.1 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  31.91 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  27.84 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  30.21 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  35.66 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  34.31 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  31.91 
 
 
303 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.57 
 
 
283 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  32.82 
 
 
489 aa  68.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  32.61 
 
 
292 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  31.41 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.1 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  30.17 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  30.17 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  30.17 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  30 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  33.12 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  32.28 
 
 
523 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  32.26 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  32.56 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.77 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  33.96 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  33.96 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  33.12 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.56 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  32.64 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.03 
 
 
541 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  33.56 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  31.58 
 
 
281 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  29.63 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  40 
 
 
342 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  29.94 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  29.63 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  38.55 
 
 
306 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  28.49 
 
 
313 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  32.93 
 
 
513 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  31.96 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  31.29 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  32.35 
 
 
293 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  36.43 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  30.71 
 
 
141 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  31.15 
 
 
298 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  30.94 
 
 
292 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  30.6 
 
 
302 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  29.85 
 
 
362 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  29.23 
 
 
381 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  27.03 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  36.27 
 
 
541 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  36.27 
 
 
547 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  38.54 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  32.86 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  32.08 
 
 
224 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  31.91 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.41 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  29.29 
 
 
280 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
625 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  35.71 
 
 
625 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  29.05 
 
 
360 aa  58.2  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 
625 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>