More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1145 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  100 
 
 		 209 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  44.59 
 
 		 327 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  44.08 
 
 		 292 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  40 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  44.17 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  42.14 
 
 		 519 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  44.06 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  40.61 
 
 		 303 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  36.93 
 
 		 342 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  35.5 
 
 		 396 aa  96.7  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  37.57 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  37.14 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  39.13 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  42.11 
 
 		 271 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  38.71 
 
 		 268 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  41.06 
 
 		 386 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  42 
 
 		 287 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  45.99 
 
 		 292 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  41.89 
 
 		 282 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  40.54 
 
 		 315 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  38.85 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  41.32 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  35.59 
 
 		 356 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  43.61 
 
 		 554 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  38.22 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  40.62 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  42.86 
 
 		 281 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  39.69 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  43.8 
 
 		 293 aa  89  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  40.76 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  38.36 
 
 		 286 aa  88.2  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  40.88 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  39.86 
 
 		 541 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  40.97 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  42.86 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  38.97 
 
 		 515 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  40 
 
 		 511 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  37.67 
 
 		 487 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  37.67 
 
 		 487 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  35.98 
 
 		 267 aa  85.5  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  42.06 
 
 		 489 aa  85.5  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  36.99 
 
 		 486 aa  85.1  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  35.62 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  38.89 
 
 		 569 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  37.64 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  39.86 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  37.76 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  34.25 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  43.08 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  43.2 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  38.99 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  34.97 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  37.72 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  31.74 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  34.97 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  27.53 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  40.46 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  37.4 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  39.16 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  38.62 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  37.01 
 
 		 669 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  38.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  34.42 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  38.22 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  40.37 
 
 		 360 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  38.17 
 
 		 547 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  38.17 
 
 		 541 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  36.3 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  39.74 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  39.74 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  39.74 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  39.88 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  40.37 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  34.56 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  34.13 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  34.46 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  36.94 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  38.01 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  45.24 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  40.15 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  34.27 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  33.85 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  39.16 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  33.54 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  41.04 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  34.44 
 
 		 430 aa  71.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  35.09 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  34.16 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  35.98 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  35.98 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  38.31 
 
 		 625 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  38.31 
 
 		 625 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  32.65 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.31 
 
 		 625 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  40.62 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>