231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9252 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  62.84 
 
 		 570 aa  346  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  49.03 
 
 		 669 aa  260  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  43.14 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.75 
 
 		 556 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  39.35 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  38.79 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  38.79 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 422 aa  92  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  34.3 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  33.93 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  35.26 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  32.74 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.54 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.82 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  40.13 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  35.03 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  31.25 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  31.66 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  34.23 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  31.43 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  31.43 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.76 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  36.14 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  31.79 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  33.96 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  33.96 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  34.27 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  33.54 
 
 		 386 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  32.7 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  33.12 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34.59 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  33.11 
 
 		 182 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  33.78 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  34.5 
 
 		 554 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  33.74 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  30.54 
 
 		 519 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  39.58 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  31.51 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  32.72 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  40 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  39.02 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  33.92 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  28.49 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  26.29 
 
 		 522 aa  66.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  41.56 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  32.41 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  31.32 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  36.27 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  35.33 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  31.32 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  30.89 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  27.62 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  35.71 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  30.67 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  35 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  31.72 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  30.06 
 
 		 747 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  38.2 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  31.28 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  38.89 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  38.75 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  27.39 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  32.24 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.77 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  32.41 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  29.93 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  30.87 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  26.75 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  30.43 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.91 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  28.88 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  28.85 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  29.63 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  31.76 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  33.01 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  35.9 
 
 		 541 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 523 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  28.77 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  36.14 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  36.14 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  36.14 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  28.24 
 
 		 444 aa  55.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>