154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03630 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  875    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  33.62 
 
 		 556 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  30.56 
 
 		 503 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  31.16 
 
 		 261 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  27.54 
 
 		 570 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.2 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  26.19 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  32.35 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.35 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  33.14 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  24.88 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  31.28 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  28.14 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.9 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.81 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  27.67 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  27.68 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  26.29 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  28.73 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  27.08 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  34.75 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  37.11 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.19 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.19 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  30.06 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  31.49 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  39.51 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  29.53 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  32.48 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  26.95 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  29.05 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  35.37 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  26.87 
 
 		 186 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.2 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  30.99 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  27.31 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  34.69 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.22 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  27.34 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  37.93 
 
 		 141 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  32.03 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  27.92 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  27.05 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  24.86 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  29.56 
 
 		 303 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  32.33 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  29.56 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  25.19 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  26.24 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  28.85 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  26.24 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  31.13 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  31.5 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  31.43 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  26.24 
 
 		 190 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  26.24 
 
 		 190 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  29.71 
 
 		 284 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.25 
 
 		 267 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  28.47 
 
 		 211 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  26.19 
 
 		 625 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  38.16 
 
 		 342 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  25.53 
 
 		 190 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  28.41 
 
 		 230 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  28.68 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  32.89 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  37.97 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  28.75 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  30 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 		 625 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  23.36 
 
 		 190 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  27.88 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  25.4 
 
 		 625 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  32.62 
 
 		 747 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  27.89 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.4 
 
 		 625 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  27.89 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  36.43 
 
 		 238 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  26.85 
 
 		 236 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 292 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  25.23 
 
 		 359 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  33.73 
 
 		 298 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  27.27 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  38.82 
 
 		 232 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  24.06 
 
 		 182 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 523 aa  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  30.66 
 
 		 315 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  26.97 
 
 		 248 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  37.97 
 
 		 237 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  28.15 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  32.32 
 
 		 263 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  30 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  30.77 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 228 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  32.47 
 
 		 273 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>