208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4233 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  100 
 
 		 211 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3383  rhomboid family protein  60 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4052  rhomboid family protein  43.75 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0629739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3327  rhomboid family membrane protein  43.75 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0229306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  36.24 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  36.3 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1256  rhomboid family protein  27.53 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1218  rhomboid family protein  27.53 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  37.76 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1937  rhomboid family protein  30.22 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  31.53 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  37.16 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  36.13 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  34.21 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  34.01 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  42.55 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  35.92 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  35.42 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  33.83 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  30.37 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  35.97 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  45.24 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  27.72 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  34.53 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5125  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  37.41 
 
 		 554 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  46.84 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  30.69 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.06 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  29.26 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1723  rhomboid-like protein  28.12 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  31.16 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.33 
 
 		 487 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.33 
 
 		 487 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  30.19 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  24.46 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  36.43 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  30.9 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  28.87 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  29.15 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  40.22 
 
 		 511 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3232  rhomboid family protein  31.75 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0778349  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  30.82 
 
 		 669 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  29.58 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  30 
 
 		 286 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  34.01 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  30.91 
 
 		 273 aa  52.4  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  27.9 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  42.31 
 
 		 291 aa  52.4  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  35.56 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.88 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  31.12 
 
 		 356 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  27.98 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  34.21 
 
 		 261 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  28.16 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.09 
 
 		 365 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  33.81 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 286 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  32.31 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 342 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  27.4 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  32.31 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  32.31 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  42.11 
 
 		 155 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  32.89 
 
 		 422 aa  51.6  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.03 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  30.83 
 
 		 305 aa  51.6  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  29.71 
 
 		 286 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  31.11 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  33.79 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 486 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  44.87 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  36.11 
 
 		 371 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  25.21 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  36.23 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  27.43 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  29.79 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  29.37 
 
 		 359 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  27.11 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  46.84 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  28.02 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  29.79 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  25.35 
 
 		 396 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  31.78 
 
 		 302 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  31.52 
 
 		 298 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  31.69 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  34.21 
 
 		 360 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  27.72 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  28.02 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  31.33 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  31.62 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  27.72 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  33.83 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>