299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
305 aa  615  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  50 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  49.81 
 
 
315 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  51.46 
 
 
282 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  47.76 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  41.5 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  47.84 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  41.61 
 
 
289 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  41.29 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  41.29 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  41.48 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  42.86 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  41.91 
 
 
286 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  42.47 
 
 
279 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  42.35 
 
 
302 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  42.96 
 
 
290 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  43.19 
 
 
287 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  47.76 
 
 
278 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  37.98 
 
 
291 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  40.93 
 
 
303 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  41.06 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  40.21 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  40 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  38.63 
 
 
313 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  41.18 
 
 
317 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  38.27 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  40 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  38.17 
 
 
298 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  44.85 
 
 
238 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  36.46 
 
 
336 aa  149  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  33.23 
 
 
359 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  34.18 
 
 
381 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  37.28 
 
 
274 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  39.03 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  34.87 
 
 
306 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  31.97 
 
 
356 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  37.58 
 
 
201 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  36.76 
 
 
327 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  30.68 
 
 
234 aa  89  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  34.88 
 
 
240 aa  85.5  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  35.26 
 
 
579 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  34.1 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  34.87 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  32.26 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  32.26 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.49 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  23.88 
 
 
519 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  26.49 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  29.35 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  36.69 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.64 
 
 
356 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.28 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  38.26 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  25.37 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.5 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  34.24 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  30.73 
 
 
569 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.54 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  37.5 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  28.92 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  33.87 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  38.97 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  29.38 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  32.18 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  32.58 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  40.31 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28.06 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  34.34 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.65 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  32.68 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  31.89 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  29.35 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  32.75 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  35.55 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  32.37 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  29.38 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  35.21 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  34.34 
 
 
218 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  34.38 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  40.71 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  33.92 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  38.78 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  29.07 
 
 
541 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  27.5 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  26.24 
 
 
515 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  30.43 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  29.33 
 
 
218 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  29.95 
 
 
396 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  45.98 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  45.98 
 
 
220 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  37.5 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  36.89 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  30.58 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  36.36 
 
 
224 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  32.63 
 
 
198 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  31.54 
 
 
227 aa  63.5  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  32.11 
 
 
198 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  32.75 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  32.75 
 
 
360 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  34.04 
 
 
228 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>