More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3140 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  60.15 
 
 		 259 aa  292  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  44.4 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  42 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  40.15 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  39.34 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  40.46 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  40 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  37.45 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  39.48 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  37.07 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  38.84 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  38.85 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  36.95 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  34.58 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  36.33 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  35.15 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  33.47 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  36.1 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  36.97 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  32.77 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  37.86 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  34.66 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  31.98 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  37.45 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  34.41 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  36.4 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  42.04 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  35.04 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  32.91 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  34.87 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  34.76 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  34.51 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  35.51 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  35.8 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  36.13 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  35.88 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  37.96 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  35.44 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  38.74 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  38.34 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  35.86 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  35.39 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  38.74 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  33.73 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  35.59 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  33.2 
 
 		 362 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  35.17 
 
 		 324 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  31.69 
 
 		 232 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  36.21 
 
 		 211 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  35.32 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  33.89 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  32.5 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  33.6 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  34.16 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  30.99 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  31.67 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  34.27 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  38.71 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  30 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  34.6 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  32.05 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  31.67 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  39.75 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 360 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 360 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0839  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  33.05 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  34.96 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  32.34 
 
 		 228 aa  96.3  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  27.95 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 360 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  31.56 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  28.4 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  36.2 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  33.95 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  31.65 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1551  rhomboid-like protein  27.62 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  31.78 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  34.85 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  31.67 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  37.2 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0405  Rhomboid family protein  42.18 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  34.19 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  35.15 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  34.44 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  36.26 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  33.93 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1953  Rhomboid family protein  26.09 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  34.56 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  26.02 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2016  rhomboid-like protein  34.84 
 
 		 504 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  33.73 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>