More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1155 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  100 
 
 		 155 aa  310  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  53.97 
 
 		 197 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  51.16 
 
 		 234 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  50.4 
 
 		 197 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  53.97 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  53.97 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  48.82 
 
 		 238 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  47.29 
 
 		 220 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  51.18 
 
 		 260 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  51.18 
 
 		 260 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  49.64 
 
 		 229 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  46.4 
 
 		 198 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  48.91 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  48.91 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  48.91 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  48.91 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  41.22 
 
 		 220 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  43.48 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  40.46 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  38.97 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 273 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  39.86 
 
 		 232 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  43.31 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  39.53 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  40.94 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  41.73 
 
 		 292 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  51.22 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  40.16 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  35.97 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  38.76 
 
 		 273 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  45.78 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  39.23 
 
 		 273 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  36.72 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  36.81 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  36.92 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  38.81 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  38.93 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  40.44 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  38.06 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  47.62 
 
 		 285 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  45.05 
 
 		 237 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  34.38 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  34.46 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  38.21 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  29.79 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  32.05 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  39.42 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  47.5 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  42.34 
 
 		 209 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  38.46 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  37.3 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  39.57 
 
 		 569 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  38.46 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  37.21 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  44.44 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  38.46 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  42.16 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 258 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  42.16 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 238 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  45.78 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  32.7 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  39.74 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  32.7 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  40.51 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  40.45 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  40.86 
 
 		 292 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  34.72 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  30.63 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  31.11 
 
 		 292 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  31.78 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.26 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  36.71 
 
 		 486 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  40.51 
 
 		 511 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  34.51 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.81 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  32.81 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  31.91 
 
 		 519 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  38.97 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  45.12 
 
 		 369 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.07 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  40 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  37.07 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  33.83 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  36.51 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  45.24 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  36.71 
 
 		 487 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  36.71 
 
 		 487 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  35.25 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  36.84 
 
 		 298 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  42.86 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  42.7 
 
 		 315 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  42.31 
 
 		 245 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>