More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1572 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  100 
 
 		 260 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  99.62 
 
 		 260 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  99.56 
 
 		 229 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  98.51 
 
 		 202 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  98.51 
 
 		 202 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  98.51 
 
 		 202 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  98.51 
 
 		 202 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  84.21 
 
 		 234 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  59.3 
 
 		 197 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  56.57 
 
 		 198 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  55.05 
 
 		 197 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  50 
 
 		 197 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  50 
 
 		 197 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  38.32 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  47.85 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  38.19 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  38.69 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  41.5 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  41.41 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  44.16 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  37.61 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  37.9 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  47.02 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  39.79 
 
 		 200 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  34.9 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  35.47 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  51.18 
 
 		 155 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  37.07 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  36.22 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  33.99 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  37.74 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  38.6 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  35.68 
 
 		 444 aa  95.1  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  37.21 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  36.32 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  26.47 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  33.18 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  32.35 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  26.96 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.72 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  32.65 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  33.79 
 
 		 237 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  30.93 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  30.85 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  38.89 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  37.77 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  39.88 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  34 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  35.88 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  32.27 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  31.75 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  36.05 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  41.1 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  36.73 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  24.41 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  31.39 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  31.5 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.16 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  33.98 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  30.14 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  37.11 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  31.02 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  30.69 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  35.29 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  33.95 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  37.38 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  32.04 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  38.93 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  29.44 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  34.36 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  33.73 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  35.51 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  37.14 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  29.89 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  34.67 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  29.85 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  31.73 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  34.25 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  28.97 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  31.92 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.76 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.56 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  41.29 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  32.64 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  37.69 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  37.11 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  27.98 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  35.66 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>