More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1114 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  100 
 
 		 486 aa  975    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  67.08 
 
 		 487 aa  709    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  67.08 
 
 		 487 aa  709    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  26.91 
 
 		 365 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  38.19 
 
 		 342 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  35.33 
 
 		 569 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  37.69 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  27.76 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  34.81 
 
 		 219 aa  114  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  39.66 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  36.42 
 
 		 523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.8 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  35.07 
 
 		 236 aa  110  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  39.6 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  34.81 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.88 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.84 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  41.1 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  30.55 
 
 		 358 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  40.49 
 
 		 235 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  40.49 
 
 		 235 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  40.11 
 
 		 226 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  36.65 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  39.23 
 
 		 386 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  29.91 
 
 		 292 aa  100  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  35.12 
 
 		 225 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  32.99 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 547 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  35.8 
 
 		 302 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  33.85 
 
 		 234 aa  97.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 625 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  30.56 
 
 		 625 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.56 
 
 		 625 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  35.54 
 
 		 224 aa  96.7  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  39.26 
 
 		 223 aa  96.7  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 541 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 286 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  34.33 
 
 		 359 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  33.16 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  33.65 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  40 
 
 		 298 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  36.63 
 
 		 224 aa  93.6  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  35.9 
 
 		 228 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  31.49 
 
 		 279 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  29.44 
 
 		 625 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.02 
 
 		 267 aa  90.9  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 205 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  36.03 
 
 		 228 aa  90.1  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  34.62 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  35.06 
 
 		 396 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  29.19 
 
 		 230 aa  89.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.44 
 
 		 290 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  28.33 
 
 		 625 aa  87.8  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 286 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 190 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  36.69 
 
 		 190 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  29.13 
 
 		 284 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  36.69 
 
 		 190 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 190 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  36.69 
 
 		 190 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  31.86 
 
 		 289 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.56 
 
 		 283 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  33.7 
 
 		 271 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  32.02 
 
 		 205 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  31.37 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  31.18 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  31.37 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  31.14 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  36.36 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  34.56 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  29.95 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  32.37 
 
 		 306 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  31.95 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.1 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  31.95 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  33.69 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  33.16 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  30.29 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  34.53 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  33.82 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  31.29 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  31 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  29.91 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  31.1 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  29.59 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  34.25 
 
 		 275 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  29.27 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  27.24 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  31.65 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  31.97 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  31.35 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  30.23 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  30.18 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  43.75 
 
 		 209 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  33.1 
 
 		 227 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>