More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31680 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  46.41 
 
 		 519 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  40.12 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  34.39 
 
 		 227 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  42.58 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  41.3 
 
 		 511 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  39.74 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  35.96 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.99 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  38.12 
 
 		 342 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  44.59 
 
 		 554 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  37.63 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  36.6 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  45.52 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  37.97 
 
 		 569 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 342 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  33.5 
 
 		 389 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  38.22 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  42.55 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  41.84 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 487 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 487 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  37.41 
 
 		 287 aa  92  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  34.24 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  41.38 
 
 		 371 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  36.08 
 
 		 219 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.18 
 
 		 486 aa  89  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  36.77 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 541 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  38.69 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  36.65 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  31.6 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.8 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.63 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  31.6 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  31.6 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  33.74 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  34.22 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  36 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  32.45 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  35.46 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  34.01 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.79 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  40.17 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  43.05 
 
 		 747 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  31.69 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  39.42 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.94 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  37.33 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  31.36 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  30.39 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  31 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  34.86 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  37.35 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  37.33 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  30.5 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  36.42 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  34.18 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  32.56 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  39.37 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  41.9 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  27.84 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  32.4 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 520 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  34.07 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.72 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  35.54 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  28.8 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  27.66 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 422 aa  68.9  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  27.66 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  29.11 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  35.51 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  37.23 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0479  Rhomboid family protein  34.71 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000451425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  39.39 
 
 		 625 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  33.87 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  29.69 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  27.27 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0462  Rhomboid family protein  34.71 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 625 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.36 
 
 		 625 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  36.36 
 
 		 625 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  27.51 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  36.51 
 
 		 515 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  28.8 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  31.8 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.54 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  34.96 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>