194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1263 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  48.63 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  42.16 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  42.94 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  44 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  44 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  43.43 
 
 		 172 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  45.4 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  27.41 
 
 		 444 aa  65.5  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.96 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  27.8 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  28.43 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  30.99 
 
 		 342 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  37.25 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30.85 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  30.08 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.84 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  36.36 
 
 		 625 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  30.77 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.63 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  31.37 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  30.99 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.95 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  30.06 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  31.87 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 		 625 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  34.09 
 
 		 625 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.75 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.09 
 
 		 625 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  28.37 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  28.37 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  27.16 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  42.68 
 
 		 492 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  26.83 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  31.22 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  38.82 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  27.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  30.39 
 
 		 273 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  28.76 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  27.51 
 
 		 292 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  31.55 
 
 		 360 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  36.78 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  39.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  28.72 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  31.2 
 
 		 251 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  26.05 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 496 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  35.35 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 327 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.26 
 
 		 554 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  32.95 
 
 		 625 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  36.56 
 
 		 264 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  26.88 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  29.5 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  32.03 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1636  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  27.27 
 
 		 310 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  33.96 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  39.56 
 
 		 264 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  32.62 
 
 		 362 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  33.82 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  38.46 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  37.04 
 
 		 523 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  32.39 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  30.91 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  39.24 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35.8 
 
 		 511 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  25.99 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.21 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  28.99 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  36.71 
 
 		 252 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  32.26 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  35.11 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  38.46 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  26.99 
 
 		 318 aa  48.5  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0987  rhomboid-like protein  31 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.769886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  32.26 
 
 		 289 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 289 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  28.57 
 
 		 342 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  30.29 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  32.23 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  30 
 
 		 291 aa  48.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  27.44 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  33.88 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  35.56 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  33.86 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  27.11 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  34.62 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 422 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>