More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0591 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  94.24 
 
 		 625 aa  1188    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  94.56 
 
 		 625 aa  1192    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  100 
 
 		 625 aa  1278    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  94.72 
 
 		 625 aa  1191    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  94.24 
 
 		 625 aa  1188    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  28.48 
 
 		 639 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.55 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  37.38 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  25.98 
 
 		 486 aa  97.4  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 487 aa  97.4  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 487 aa  97.4  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 389 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  33.15 
 
 		 523 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  35.78 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  39.39 
 
 		 513 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  35.64 
 
 		 376 aa  94.4  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  32.88 
 
 		 386 aa  94  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  34.66 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 348 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  36.42 
 
 		 236 aa  92.8  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  34.66 
 
 		 541 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34 
 
 		 327 aa  91.3  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.83 
 
 		 519 aa  90.5  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.86 
 
 		 283 aa  90.5  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  34.33 
 
 		 248 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  37.65 
 
 		 569 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  38.41 
 
 		 358 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  29.96 
 
 		 511 aa  87.8  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.54 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.42 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 342 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  38 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 342 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 235 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 235 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  34.46 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  34.41 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  36.55 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  34.46 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  35.86 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  33.74 
 
 		 226 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  33.96 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  31.55 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.92 
 
 		 689 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  33.33 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  30.77 
 
 		 391 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  33.97 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  29.22 
 
 		 223 aa  69.3  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  32.09 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.26 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  31.52 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  32.08 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  30.1 
 
 		 669 aa  67  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  26.92 
 
 		 580 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  33.82 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  30.86 
 
 		 234 aa  67  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  34.39 
 
 		 302 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.84 
 
 		 354 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.2 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.39 
 
 		 312 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  31.18 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  30.58 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  31.84 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  26.88 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.41 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  65.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.08 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  28.81 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  28.97 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1667 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  29.36 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.43 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  27.69 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.78 
 
 		 974 aa  64.7  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.12 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  35.8 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  32.26 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  29.55 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  35.42 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  28.65 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  38.89 
 
 		 291 aa  63.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  33.75 
 
 		 198 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.22 
 
 		 821 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  30 
 
 		 381 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  31.16 
 
 		 190 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.32 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  30.34 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  31.16 
 
 		 190 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  30.71 
 
 		 172 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  30.91 
 
 		 360 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  28.89 
 
 		 238 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 190 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  26.71 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.17 
 
 		 328 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>