265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0239 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  39.21 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  38.7 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  34.98 
 
 		 444 aa  118  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  36.04 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  38.65 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  38.25 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  36.87 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  35.09 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  35.65 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  38.1 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  36.7 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  37.62 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  36.53 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  34.06 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  34.82 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  33.88 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  37.7 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  36.07 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  34.11 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  35.85 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  36.2 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  34.8 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  31.8 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  36.27 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  35.27 
 
 		 360 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  35.27 
 
 		 360 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  40.12 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  35.02 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  33.77 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  34.82 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  39.23 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  32.91 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  34.32 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  35.65 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  36.45 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  39.77 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  39.23 
 
 		 371 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  37.61 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  37.99 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  34.65 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0839  rhomboid family protein  39.71 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  35.89 
 
 		 211 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  36.81 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  31.84 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 232 aa  95.1  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  36.46 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  37.95 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  38.28 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  31.7 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  35.14 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  39.47 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  35.53 
 
 		 222 aa  92  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  31.6 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  36.71 
 
 		 360 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.99 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.24 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  35.19 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  40.23 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  29.88 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  37.89 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  30.29 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  35.89 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  39.66 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  35.52 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  38.61 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  32.16 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  30.84 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  47.52 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  30.67 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1953  Rhomboid family protein  35.58 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  32.08 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  36 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  48.91 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  41.91 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  33.76 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  37.95 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.95 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0405  Rhomboid family protein  40 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  38.52 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  29.82 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.84 
 
 		 519 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  31.79 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  35.2 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  29 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  30.98 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  31.68 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  29.52 
 
 		 386 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  33.73 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  29.59 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  30.39 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>