292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2632 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  72.97 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  58.77 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  59.08 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  51.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28.57 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  35.71 
 
 		 207 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  38.69 
 
 		 219 aa  95.9  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.16 
 
 		 205 aa  86.3  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  34.31 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  34.19 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  33.11 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.45 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  32.57 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  55.81 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.96 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  31.46 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  31.97 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  31.65 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4170  Rhomboid family protein  31.06 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.303634  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  35.46 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  35.78 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  34.94 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.8 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  32.62 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  30.81 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  34.41 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  31.41 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  64.1 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  30.72 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  34.41 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  31.08 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  30.07 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  30.57 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  33.88 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  29.75 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.72 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  33.33 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  36.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  31.1 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  29.65 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  30.9 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  24.32 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  27.19 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  26.34 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  27.45 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  31.47 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  27.32 
 
 		 231 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  27.27 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  33.13 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  25.89 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  35.23 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  25.89 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  31.61 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.94 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  27.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  32.69 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  31.91 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  27.18 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  27.57 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  27.35 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  31.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  29.53 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.62 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  30.26 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  27.75 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.16 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  32.41 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  26.19 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.33 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  29.33 
 
 		 177 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  27.72 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  27.72 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 197 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  27.72 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  32.75 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  29.31 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  51.28 
 
 		 90 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  27.72 
 
 		 276 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  28.76 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  27.72 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  35.64 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  28.1 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  27.92 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 172 aa  53.1  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  28.49 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  29.21 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.42 
 
 		 226 aa  52.8  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>