126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1552 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.44 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  33.52 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  30.92 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  33.15 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.94 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  29.22 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.2 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  27.38 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  29.3 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.17 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  29.17 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30.92 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  28.85 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  31.43 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  27.97 
 
 		 519 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  31.37 
 
 		 299 aa  51.6  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  27.59 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  44.64 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  26.55 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.93 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  26.9 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  29.44 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  27.86 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  30.72 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  25.32 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  29.68 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  28.88 
 
 		 285 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  31.39 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  28.8 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  24.82 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  24.82 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  27 
 
 		 444 aa  48.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.73 
 
 		 554 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  27.72 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  31.25 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  28.97 
 
 		 303 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  27.63 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  30.11 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  30.11 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  29.27 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  25.76 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  28.85 
 
 		 541 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  25.76 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  28.07 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  27.41 
 
 		 288 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.28 
 
 		 365 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  32.41 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  33.94 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  27.81 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.07 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.36 
 
 		 290 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  28.57 
 
 		 284 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  28.29 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  30.14 
 
 		 486 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  31.65 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  31.01 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  29.17 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  28.27 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  26 
 
 		 292 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  34.41 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  31.91 
 
 		 253 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  39.19 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  26.11 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  36.59 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  28.17 
 
 		 292 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 262 aa  45.1  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  34.12 
 
 		 571 aa  44.7  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.98 
 
 		 396 aa  44.7  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  29.93 
 
 		 302 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  28.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  29.08 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  27.54 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  31.82 
 
 		 306 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  32.14 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  27.47 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  30.3 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  25.53 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  33.01 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  30.16 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  26.76 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0937  rhomboid family protein  27.89 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  26.22 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  25.82 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  35 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  30.43 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 547 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  35.16 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 303 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  26.49 
 
 		 261 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 625 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>