195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0277 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  36.99 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  34.33 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  32.57 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  31.91 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30.16 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  30.89 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  34.97 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  30.67 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  30.82 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  29.69 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  29.14 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  30.45 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  28.71 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  37.11 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  34.14 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  25.87 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  36.54 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  33.67 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  29.6 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  32.21 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  42.18 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.66 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  34.81 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  38.67 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  43.54 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  43.54 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  42.86 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  33.52 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  32.96 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  34.05 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  28.76 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  35.98 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  31.79 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  32.41 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  42.86 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  28.28 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  42.86 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  42.86 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  42.86 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  31.28 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  28.5 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  30.97 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.65 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  37.59 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  32.35 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 444 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  29.35 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  25.97 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  35.22 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  27.8 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  27.84 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.96 
 
 		 486 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  34.01 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  30.77 
 
 		 522 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  27.41 
 
 		 487 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  27.41 
 
 		 487 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  28.85 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  32.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  25.59 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  41.03 
 
 		 302 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 239 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  29.74 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  29.76 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  30.97 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  38.95 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  35.79 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  28.9 
 
 		 513 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  42.39 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  31.02 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  29.47 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  36.59 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  36.27 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  32.7 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  28.48 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  36.17 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1812  hypothetical protein  24.89 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.515033  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  29.22 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  33.11 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  31.51 
 
 		 230 aa  49.7  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  30.59 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  25.1 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  31.45 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  33.56 
 
 		 197 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  24.6 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  32.54 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  31.94 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  29.14 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  34.18 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  29.14 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>