19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1812 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.515033  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  28.02 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.81 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  28.95 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  27.59 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  26.51 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  28.38 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  25.82 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  25.28 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.24 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  24.89 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  25.94 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  28.02 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  27.52 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  24.69 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  20.99 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  22.94 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  35.19 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>