132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1403 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  38.16 
 
 		 299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  35.03 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  36.33 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  35.18 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  36.47 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  36.71 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  34.5 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  32.77 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  29.01 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  28.52 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  27.86 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  24.81 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.51 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  29.89 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  30.67 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  27.92 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.28 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  32.45 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  26.64 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  27.72 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  34.09 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  31.37 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  41.67 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  42.71 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  41.67 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.88 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  27.27 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  34.84 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  38.57 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  41.18 
 
 		 155 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  35.22 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4634  rhomboid family protein  40 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.248838  normal  0.0634854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.88 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  31.13 
 
 		 209 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  30.14 
 
 		 220 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  34.04 
 
 		 234 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  30 
 
 		 376 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  26.46 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  32.02 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  31.47 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  31.37 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  36.88 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2260  rhomboid family protein  41.3 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  31.37 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  26.06 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  33.9 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 172 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  28.15 
 
 		 444 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  34.16 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  30 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2535  Rhomboid family protein  41.3 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.87171 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  32.89 
 
 		 197 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  34.16 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1188  rhomboid family protein  33.7 
 
 		 181 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0257893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  32.43 
 
 		 230 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  27 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.65 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  34.78 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  29.77 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  27.95 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  25.85 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  27.12 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  30.99 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  34.78 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  34.78 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  34.78 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  34.78 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  28.99 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2217  Rhomboid family protein  36.96 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  37.5 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  25 
 
 		 342 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  26.55 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  28.21 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  28.65 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  24.44 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  32.09 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5125  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  29.01 
 
 		 172 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.07 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  26.84 
 
 		 200 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  26.53 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  26.25 
 
 		 625 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  32.88 
 
 		 196 aa  45.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  36.25 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  30.07 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  27.09 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  29.81 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.01 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.67 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  26.35 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>