90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07080 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  100 
 
 		 299 aa  607  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  43.33 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  39.04 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  38.93 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  36.18 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  38.52 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  33.79 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  37.07 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  31.96 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.69 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  31.2 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  30.5 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.06 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  31.8 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  31.97 
 
 		 264 aa  89.7  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  28.87 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  31.4 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.22 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  29.03 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  31.33 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  33.55 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  30.26 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  27.16 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  32.7 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  27.67 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  27.05 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  28.1 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  27.03 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  32.38 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  26.89 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  28.49 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  28.48 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  29.12 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  28.23 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  31.86 
 
 		 190 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  36.45 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  26.8 
 
 		 205 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  31.37 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  30.99 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  26.07 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  32.29 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 492 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  30.2 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  27.59 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  28.49 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  30.34 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  27.08 
 
 		 197 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  25 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  27.03 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  28.57 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  28.57 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  30.37 
 
 		 525 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  30.39 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.2 
 
 		 228 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  27.23 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  24.47 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  28.83 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2016  rhomboid-like protein  22.82 
 
 		 504 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  30.3 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  29.12 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1637  rhomboid family protein  28.37 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  29.7 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  32.76 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  26.7 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  29.67 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2186  rhomboid family protein  27.54 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.34 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  29.67 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  29.67 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  29.67 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  30.16 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  26.02 
 
 		 528 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  26.4 
 
 		 569 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  25.16 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  27.91 
 
 		 520 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  27.91 
 
 		 520 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  25.71 
 
 		 513 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3678  rhomboid family protein  36.79 
 
 		 483 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0309467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 224 aa  42.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  27.94 
 
 		 226 aa  42.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  24.24 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  30 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>