176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0599 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  100 
 
 		 321 aa  640    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  51.17 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  46.42 
 
 		 326 aa  256  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  46.86 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  49.32 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  31.29 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  32.4 
 
 		 207 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  40.54 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  33.99 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  35.03 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  35.37 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  35.85 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  36.65 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  32.3 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  34.9 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  41.22 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.09 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.88 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  42.11 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  31.21 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  35.79 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  40.48 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  34.53 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  29.11 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  31.87 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  33.53 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  34.13 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  34.85 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  28.26 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  33.07 
 
 		 190 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  37.78 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  31.09 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  30.05 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  34.81 
 
 		 260 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  27.56 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  35.45 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  22.17 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.43 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  33.91 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  30.82 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  34.18 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1787  AN1-type Zinc finger protein  50 
 
 		 73 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  33.97 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  31.33 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  40.23 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  39.33 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  31.87 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.11 
 
 		 444 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  20.87 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  32.85 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  30.95 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 226 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  36.56 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  34.18 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.64 
 
 		 232 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  29.61 
 
 		 252 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.25 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.02 
 
 		 226 aa  52.8  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  28.75 
 
 		 227 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  29.11 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  27.85 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  34.62 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.68 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  32.24 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  32.5 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4170  Rhomboid family protein  29.1 
 
 		 214 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.303634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  27.13 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  34.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  25.33 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  34.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  34.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  34.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 541 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0458  Zinc finger, AN1-type  43.75 
 
 		 111 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  32.63 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  27.61 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  32.38 
 
 		 261 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  31.67 
 
 		 253 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  34.9 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  26.55 
 
 		 247 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  31.01 
 
 		 249 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  34.41 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  27.18 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  30.51 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  25.33 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  28.24 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  28.3 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  37.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  29.14 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  36.46 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>