125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1002 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  100 
 
 		 200 aa  380  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  50.51 
 
 		 219 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  50.26 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  46.81 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0158  Rhomboid family protein  50.6 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1636  Rhomboid family protein  34.74 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  33.51 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  34.39 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.82 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  38.04 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  28.31 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  27.11 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  28.57 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  30.41 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.5 
 
 		 360 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  25.68 
 
 		 342 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  32.1 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  28.66 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  24.44 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  25.68 
 
 		 342 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  27.08 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  30.05 
 
 		 326 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  27.09 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  24.86 
 
 		 279 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  25.32 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  35.23 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  28.29 
 
 		 286 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  25.31 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  29.22 
 
 		 303 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  24.31 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  31.17 
 
 		 303 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05655  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  30.63 
 
 		 275 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0494961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  25.69 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  30.41 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  37.89 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.56 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  29.27 
 
 		 386 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  25.17 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  26.85 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 360 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  38 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  28.3 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 360 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13571  hypothetical protein  20.34 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  27.42 
 
 		 360 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  29.75 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.07 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  31.34 
 
 		 281 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  26.67 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 		 625 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  32.28 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.09 
 
 		 625 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  29.88 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  34.09 
 
 		 625 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  26.75 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  24.67 
 
 		 172 aa  45.1  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  29.75 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  25.16 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  29.41 
 
 		 277 aa  44.7  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  34.72 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  27.85 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  23.84 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  30.11 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  34.12 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  26.67 
 
 		 299 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  29.49 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  26.42 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13471  hypothetical protein  18.08 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  32.22 
 
 		 511 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  36.56 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  26.84 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  27.16 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  34.12 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  32.98 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  25.31 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3678  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 483 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0309467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  29.17 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  27.45 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  30.89 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  30.85 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  23.08 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  31.4 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  30.59 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 292 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  30.59 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  26.42 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  24.63 
 
 		 348 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  30.06 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  35.63 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>