More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0305 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  100 
 
 		 230 aa  440  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  79.81 
 
 		 214 aa  337  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0329  rhomboid family protein  70.8 
 
 		 226 aa  291  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0365  hypothetical protein  70.8 
 
 		 226 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  33.49 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  37.23 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  36.96 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  41.25 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  37.91 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  37.91 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  41.07 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  39.29 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  34.87 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  35.68 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  34.43 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  34.3 
 
 		 232 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  40.4 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  38.65 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  38.36 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  39.6 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  37.84 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  38.32 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  37.25 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  34.05 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  32.69 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  30.48 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  39.51 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  40.79 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  35.63 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1953  Rhomboid family protein  39.33 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  36.88 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  36.27 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  35.67 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  34.27 
 
 		 248 aa  92  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  30.17 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  35.86 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  33.78 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  39.73 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  41.72 
 
 		 444 aa  88.6  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  39.57 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  36.77 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  34.23 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  30.23 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  38.51 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  35.86 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  41.33 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  38.19 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  39.47 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  31.94 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  39.19 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  40.28 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  35.06 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  39.31 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  34.27 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  37.96 
 
 		 492 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3678  rhomboid family protein  40.5 
 
 		 483 aa  79  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0309467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  38.19 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  38 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  35.42 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  36.69 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1551  rhomboid-like protein  35.97 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  38.19 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  42.98 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  34.46 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  32.68 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  32.85 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  35.14 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  45.78 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  45.78 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.78 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  34.93 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  31.68 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0839  rhomboid family protein  32.85 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  35.21 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  34.42 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  37.34 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  32.48 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  32.7 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0405  Rhomboid family protein  39.46 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2016  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  44.58 
 
 		 625 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  31.97 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>