17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13471 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_13471  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13571  hypothetical protein  87.5 
 
 		 200 aa  347  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12071  hypothetical protein  42.78 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0485  rhomboid family membrane serine protease  42.27 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03641  rhomboid family protein  35.98 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  25.56 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  28.5 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  28.03 
 
 		 541 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  25.85 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  23.6 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  28 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  26 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0479  hypothetical protein  33 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.869927  normal  0.129695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  32.12 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  24.84 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>