53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3847 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  80.18 
 
 		 225 aa  344  8e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  74.01 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  69.19 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  50 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  43.13 
 
 		 211 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  48.36 
 
 		 218 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  46.34 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  40.86 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  41.62 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  40.31 
 
 		 195 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  41.5 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  40.31 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  41.5 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  43.88 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  37.76 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  36.32 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  35.22 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  34.01 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  42.25 
 
 		 208 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  40.22 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  35.79 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  36.45 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  32.8 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  37.81 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  36.63 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  41.9 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  39.78 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  36.51 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  35.29 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  34.71 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  36.26 
 
 		 179 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  43.15 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 184 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  32.11 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  38.73 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  40.96 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  33.16 
 
 		 174 aa  88.6  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  31.13 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  28.72 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  34.91 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  30.63 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  28.77 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13571  hypothetical protein  27.32 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  31.47 
 
 		 179 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  30.07 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13471  hypothetical protein  31.76 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  30.67 
 
 		 386 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>