65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1238 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  100 
 
 		 211 aa  401  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  71.86 
 
 		 203 aa  247  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  44.5 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  44.92 
 
 		 240 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  42.78 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  39.47 
 
 		 258 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  44.81 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  46.37 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  42.62 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  41.62 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  42.62 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  42.62 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  39.46 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  40.32 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  38 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  39.15 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  36.41 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  36.41 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  40.12 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  40.56 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  43.39 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  40.11 
 
 		 194 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  45.39 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  41.38 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  38.32 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  34.38 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  42.6 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  31.61 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  34.86 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  41.57 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  42.65 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  38.29 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  34.12 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  29.08 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  39.24 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  44.17 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  30 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  34.46 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  35.98 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  34.69 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  39.69 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  37.43 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  32.69 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  30.2 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  31.21 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  36.03 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  38.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  33.56 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.83 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.93 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.93 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  36.09 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.93 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  29.8 
 
 		 554 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.03 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  29.66 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  29.56 
 
 		 315 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  31.97 
 
 		 487 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  31.97 
 
 		 487 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.64 
 
 		 284 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  31.39 
 
 		 211 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  33.11 
 
 		 579 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  28.97 
 
 		 275 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>