145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4537 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  70.53 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  52.78 
 
 		 224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  55.81 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  50 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  38.71 
 
 		 191 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  42.55 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  42.55 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  40.41 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  49.12 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  47.62 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  44.19 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  42.78 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  42.44 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  44.13 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  40.5 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  41.81 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  36.17 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  38.07 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  39.5 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  37.78 
 
 		 258 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  45.24 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  40.57 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  36.79 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  42.67 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  36.6 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  36.6 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  36.6 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  39.43 
 
 		 179 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  34.24 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  39.39 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  41.36 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  40.32 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  38.64 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  39.26 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  33.7 
 
 		 184 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  31.69 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  34.29 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  36.67 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  28.76 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  34.07 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  40.14 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  32.24 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  31.25 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  28.47 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.33 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  28.44 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  35.06 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 315 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  31.69 
 
 		 519 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.19 
 
 		 365 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  32.12 
 
 		 386 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  30.97 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.41 
 
 		 356 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.55 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  31.69 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  35.56 
 
 		 356 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.56 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 292 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  30 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  36.42 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  30.82 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.51 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  29.59 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  32.64 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  31.74 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  29.59 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  30.99 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.49 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.14 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.38 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  35.77 
 
 		 305 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.14 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  26.99 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35.63 
 
 		 511 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  32.85 
 
 		 389 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.66 
 
 		 360 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  29.7 
 
 		 306 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 284 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  32.03 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  31.09 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  31.47 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.83 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 541 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  27.38 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  27.74 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  26.58 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>