74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0267 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  100 
 
 		 224 aa  440  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  59.43 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  51.83 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  52.78 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  53.07 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  42.65 
 
 		 195 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  56.89 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  41.41 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  41.41 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  45.88 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  45.88 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  44.1 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  41.21 
 
 		 191 aa  148  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  47.88 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  42.65 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  43.33 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  52.44 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  44.02 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  43.81 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  38.95 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  43.35 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  42.68 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  40.22 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  43.02 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  37.43 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  37.43 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  37.43 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  36.97 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  36.9 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  36.09 
 
 		 185 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  34.32 
 
 		 184 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  39.46 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  33.95 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 188 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  25.93 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  25.93 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  29.51 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  29.94 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  39.63 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  36.67 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  33.59 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  32.57 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  34.35 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  30.09 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  32 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  32 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  34.31 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  33.58 
 
 		 303 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  31.06 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 386 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  28.49 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  26.97 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  27.83 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  38.97 
 
 		 389 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  32.19 
 
 		 287 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 381 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  32.64 
 
 		 554 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  29.86 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  28 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  31.22 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  31.3 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  28.84 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  30.43 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  30.2 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  27.88 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  27.88 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  29.33 
 
 		 289 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>