89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0999 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  100 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  57.51 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  55.68 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  64.67 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  52.94 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  51.09 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  49.11 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  42.39 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  43.52 
 
 		 194 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  43.27 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  41.75 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  44.62 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  45.26 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  43.02 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  43.5 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  44.32 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  39.9 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  44.19 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  35.79 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  35.79 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  42.17 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  42.17 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  42.17 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  46.15 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  43.33 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  47.16 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  43.02 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  33.98 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  38.01 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  38.01 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  40.38 
 
 		 179 aa  99  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  33.88 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  39.67 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  30.06 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  32.56 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  34.69 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  34.46 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  41.15 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  36.71 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  29.29 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  35.51 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  35.5 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  33.98 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  37.33 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  36.9 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  36.5 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  33.09 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  30.73 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  38.85 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  34.22 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  37.6 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  38.52 
 
 		 286 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  38.89 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  38.89 
 
 		 289 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  38.89 
 
 		 289 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  35.04 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  35.66 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  32.21 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  32.72 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  36.2 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.52 
 
 		 290 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  28.57 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  32 
 
 		 381 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  31.1 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  37.04 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 386 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  34 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  34 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.24 
 
 		 303 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  35.14 
 
 		 365 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  34.43 
 
 		 359 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  28.18 
 
 		 523 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.86 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  32.87 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  30.22 
 
 		 486 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  32.43 
 
 		 554 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  32.28 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 487 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 487 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  35.11 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  36.22 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  38.06 
 
 		 230 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 248 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  34.88 
 
 		 389 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>