249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5574 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  100 
 
 		 228 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.92 
 
 		 486 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  36.57 
 
 		 290 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  36.87 
 
 		 292 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  36.81 
 
 		 569 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  43.38 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  37.41 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  37.41 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  43.38 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.5 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  36.92 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  35.24 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  38.06 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  36.65 
 
 		 386 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.62 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  38.06 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  38.57 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  35.75 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  35.76 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.34 
 
 		 541 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  32.17 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.71 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  37.88 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  37.88 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  37.88 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  32.17 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  35.78 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  33.83 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  44.44 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  37.14 
 
 		 356 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.44 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  34.25 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  35.47 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  40.23 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  36.75 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  38.31 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.47 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  37.41 
 
 		 327 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  32.91 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  38.06 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  35.47 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.45 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  30.23 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  36.64 
 
 		 523 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  37.76 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  38.19 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  30.2 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  37.31 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  39.73 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  32.34 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  29.7 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  31.47 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  41.1 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  38.56 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  40.37 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  28.39 
 
 		 182 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  28.47 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  37.32 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.86 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  29.66 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  31.16 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  39.49 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  31.72 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  28.64 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.21 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  25.49 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  33.16 
 
 		 625 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  38.61 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 511 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  28.64 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  30.46 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  39.13 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  34.46 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0405  Rhomboid family protein  33.84 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  33.85 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  29.85 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  35.1 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  35.88 
 
 		 639 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  33.8 
 
 		 513 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  34.25 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 		 625 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.16 
 
 		 625 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  28.64 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  33.16 
 
 		 625 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  35.17 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  31.45 
 
 		 281 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  32.68 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  31.88 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>